Aubergine - Sclerotinia sclerotiorum

Sclerotinia sclerotiorum

Sclerotiniose

Généralités

Champignon du sol largement répandu de par le monde ; bien que plutôt redouté dans les régions tempérées, il est aussi observé ponctuellement dans les régions plus chaudes mais son incidence n'a rien à voir avec celle de Sclerotium rolfsii.
Plutôt polyphage, il est capable d'infecter de nombreux légumes appartenant de divers familles botaniques(Solanacées, Cucurbitacées, Composées, etc.).
Observé en plein champ, plus dommageable sous abris, en sol mais aussi en hors sol.
Organes attaqués : tiges, inflorescences et fruits, fruilles parfois.
Symptômes :
- Fontes de semis, lésions au collet sur plantules et effondrement de celles-ci.
- Lésions allongées sur tiges s'initiant à partir de tissus sénescents ou blessés (fruits avortés, pièces florales, feuilles sénescentes, blessures de taille et diverses...). Celles-ci peuvent être localisées à proximité du collet ou réparties sur la longueur des tiges. Elles ont une apparence humide et sombre dans un premier temps, puis se nécrosent et prennent une teinte beigeâtre et brune, et finissent par les ceinturer sur plusieurs centimètres (figures 1 à 3).
- La partie distale des rameaux ceinturés, les feuilles peuvent jaunir, flétrir et se dessécher (figure 4).
- Brunissement et nécrose des tissus vasculaires (figure 5), évidement de la moelle envahit de mycélium et de sclérotes noires(figure 6)
- Pourriture humide, molle et sombre se développant sur les fruits, au niveau de la cicatrice stylaire ou au contact du sol. Elle s'étend rapidement et se généralise progressivement ; les fruits finissent par se ratatiner et/ou s'effondrer plus ou moins totalement (figure 9).
- Plantes malades réparties en foyers (figure 8)

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Signes : mycélium plus ou moins cotonneux et blanc sur tous les tissus affectés (figure 9), ainsi que de grosses structures irrégulières noires, des sclérotes qui sont plutôt allongés, mesurant 2-20 mm x 3-7 (figures 9 et 10). Petites « trompettes », des apothécies, se formant sur les plus gros sclérotes (figure 11).
Confusions possibles : Sclerotium rolfsii, Rhizoctonia solani aérien,

Biologie

Conservation : dispose de potentialités saprophytiques non négligeables. Il peut se maintenir dans le sol de 8 à 10 ans grâce a ses sclérotes (figures 9 et 10) qu'il produit sur les organes affectés et/ou sur son mycélium (figure 3) présent dans les débris végétaux abandonnés sur les parcelles. Signalé sur plus de 400 espèces végétales différentes, cultivées ou adventices, notamment de nombreuses cultures légumières (salades, haricot, choux, poivron, aubergine, nombreuses cucurbitacées, céleri, pois, carotte, rutabaga, pomme de terre, etc.) et un certain nombre de mauvaises herbes de façon inaperçue.
Sources d'inoculum : les contaminations s'effectuent par l'intermédiaire du mycélium issu des sclérotes se trouvant à proximité des organes en contact avec le sol. Contaminations aériennes possibles via des ascospores produites par des apothécies (figure 11) assurant sa reproduction sexuée. celles-ci germent sur les tissus végétaux qu'en présence d'eau issue d'une pluie, d'une irrigation par aspersion ou bien de condensation ou d'une rosée.
Infection : pénètre et envahit aisément dans les organes vivants, blessés, sénescents ou morts en contact ou non avec le sol.
Développement, sporulation : produit du mycélium et des sclérotes dans et sur les tissus.
Dissémination : par l'intermédiaire de la terre présente sur les outils aratoires ou sur des plants souillés par des sclérotes , et par les ascospores portées par le vent et les courants d'air sur des distances non négligeables.
Conditions favorables : optimum thermique situé légèrement en dessous de 20°C, mais capable de se développer à des températures comprises entre 4 et 30°C. Développement facilité par les périodes humides et pluvieuses, par les tissus ayant atteint un stade avancé, les sols légers et riches en humus.

Protection

Réaliser des rotations culturales assez longues en terrain vierge, elles ne sont plus très efficaces en sol contaminé.
Désinfection du sol possible : vapeur, fumigant, solarisation, biofongicides, etc.
Bien travailler et drainer le sol afin d’éviter la formation de flaques d’eau propices notamment à la formation des apothécies responsables des contaminations aériennes
Labourer profondément afin d’enfouir les sclérotes en profondeur qui seront plus rapidement détruits. L’immersion des parcelles infestées permettrait de réduire le nombre de sclérotes viables présents dans le sol. Orienter les rangs de plantation dans le sens des vents dominants afin que le collet des plantes et le couvert végétal soient bien aérés.
Maîtriser la fumure azotée qui ne devra être ni trop forte (à l’origine de tissus succulents très réceptifs), ni trop faible (sources de feuilles chlorotiques constituant des bases nutritives).
Diminuer l’hygrométrie ambiante des cultures et éviter la présence d’eau libre sur les plantes : aérer au maximum les abris, irriguer de préférence en cours de matinée et en début d’après-midi — jamais le soir. Préférer une irrigation localisée à un arrosage par aspersion.
Mettre en place un paillage plastique afin de créer une barrière mécanique entre le sol et les organes végétaux., voire afin de piéger les ascospores libérées des apothécies.
Eliminer les débris végétaux sains ou malades en cours et en fin de culture, ainsi que les mauvaises herbes hôtes potentiels susceptibles d’héberger ou de favoriser le développement et la conservation de ce champignon dans le sol.
Soigner l’irrigation : quantité optimale, apport localisé, etc.
Si besoin, utiliser un biopesticide à base de Coniothyrium minutans, et/ou pulvériser des fongicides en tenant compte des usages autorisés (e-phy) (Substitution).