- rachis : continuation du pétiole dans une feuille composée et qui porte soit les folioles soit les ramifications portant des folioles (figure 1).
- radical : qui nait de la racine.
- radicelles : petites racines secondaires naissant des racines principales.
- rampante : se dit d'une tige ou d'une plante étendue sur le sol.
- réceptacle : sommet élargi du pédoncule floral portant pistil et étamines ou bien une inflorescence comme chez les composées (Asteraceae, figure 2).
- réfléchi : recourbé vers le sol.
- réniforme : en forme de rein ou de haricot.
- réticulé : marqué de lignes croisées en réseau.
- rhizome : tige souterraine allongée et horizontale ou oblique émettant des tiges et des racines (figure 3).
- rhomboïdal ; en forme de losange.
- rosette : feuilles étalées en cercle autout du collet de la plante au niveau du sol, sans tige visible (figure 4).
- rugueux : dont le toucher n'est pas lisse parce que l'organe est ridé.
- scabre : se dit de feuilles ou tiges rudes au toucher, comme chez certaines rubiacées ou les boraginacées.
- scarieux : se dit d'un organe (sépale, bractée, etc.) membraneux mince et sans chlorophylle ; par exemple le périanthe chez les joncacées.
- schizocarpe : fruit composé de plusieurs éléments, i.e. pluriloculaire, dont chaque élément contient une graine (par exemple chez les ombellifères et les géraniacées) et se séparant à maturité (figure 5).
- semence : se dit de tout organe servant à la dissémination de la plante. Ce peut-être une graine ou un fruit (akène, caryopse, etc.).
- sépales : pièces florales formant le calice (figure 6).
- sessile : sans pétiole (feuille) ou sans pédoncule (inflorescence).
- silicule : silique courte et élargie (figure 7).
- silique : fructification chez les Brassicaceae (crucifères) et que l'on peut trouver aussi chez d'autres familles (Papaveraceae). Fruit sec à maturité généralement déhiscent, au moins quatre fois plus long que large et contenant plusieurs graines fixées sur une fausse cloison et protégées par deux valves (figure 8).
- sp. : abréviation de species terme latin pour espèce, le pluriel accompagnant un nom de genre s'écrit spp., l'abréviation subsp. désigne la sous espèce (subspecies).
- spathe : bractée membraneuse entourant les fleurs de certaines monocotylédones comme l'ail, l'iris ou l'arum (figure 9).
- spiciforme : se dit d'une inflorescence en forme d'épi.
- spontanée : se dit d'une espèce végétale présente naturellement dans un pays sans y avoir été introduite par l'homme (espèce autochtone).
- stigmate : partie supérieure du pistil recevant le pollen (figure 10).
- stipules : pièces foliacées ou membraneuses placées à la base des feuilles, par ex. chez les fabacées ou les géraniacées (figure 11).
- stolon : rejet rampant s'enracinant et pouvant donner une nouvelle plante comme par ex. chez le fraisier.
- supère : se dit de l'ovaire placé au dessus du niveau d'insertion des pétales et sépales, par ex. chez les renonculacées (figure 12).