Barcoding
Type de laboratoire |
Type de technique |
Objectif |
Bioagresseur(s) concerné(s) |
Temps de mise en oeuvre |
Délai de réponse du laboratoire |
Laboratoire spécialisé |
Moléculaire |
Identification |
Bactéries, Champignons, Virus, Nématodes, Insectes et Acariens |
1 semaine |
15 - 20 jours ouvrés |
Principe :
Le barcoding de l’ADN est une méthode de diagnostic générique qui utilise un fragment standard d’ADN du bioagresseur. Elle repose sur le séquençage de ce fragment, lequel est quasiment identique chez des individus de la même espèce. Le séquençage est précédé par une extraction d’ADN et une PCR. Il est ainsi possible d’identifier un individu en connaissant uniquement la séquence de ce fragment d’ADN. La lecture du barcode de l’individu mène à une bibliothèque de références où sont associées séquences d’ADN et identification fiable (taxonomique, morphologique). Un non spécialiste en systématique peut identifier une espèce qu’il ne connaît pas, sous réserve d’une bonne maitrise de la technique.
Avantages |
Inconvénients |
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