Champignons et autres pathogènes
Parmi les parasites, de très nombreux agents sont susceptibles d’induire des maladies chez les plantes ligneuses. Ils sont alors dits « pathogènes ». Les plus importants en forêt sont de loin les champignons, dont le cycle de reproduction et le mode de vie sont particulièrement diversifiés. Toutes les parties de l’arbre peuvent être attaquées, de la feuille à la racine.
D'autres organismes fongiformes voisins des champignons "vrais" causent des dommages, en particulier les oomycètes (proches des algues brunes) comme les Phytophthora.