Galeries API

Principe :

Les galeries API ou également appelées galeries de tests biochimiques miniaturisés se présentent sous la forme d’une série de petits tubes, nommés tubules, correspondant chacun à un test biochimique spécifique. Chaque tubule est ouvert à son extrémité supérieure par une cupule pouvant être remplie, ou non, de liquide afin de placer le tube dans des conditions particulières. Chaque tube contient un substrat défini (ONPG, ADH, GEL...) et avec lequel les micro-organismes réagissent différemment.

Etapes :

• Après purification des colonies bactériennes, préparer une suspension bactérienne puis en verser dans chacun des tubules de la galerie.
• Remplir la cupule pour les substrats dont le nom est encadré (CIT, VP...). L’objectif est de réaliser des tests en aérobiose (riche en oxygène).
• Remplir la cupule avec de l'huile de paraffine pour les substrats dont le nom est souligné (ADH, LDC...). Cette huile empêche le contact avec l’oxygène, créant ainsi un milieu anaérobique (absence d’oxygène) et empêche également les composés volatiles synthétisés lors de la réaction de s’échapper du tube.
• Incuber la galerie pendant 18 à 24h à température adaptée.
• Après incubation, regarder si la réaction est positive ou négative séparément pour chacun des tests.

La révélation est permise par la présence d’indicateurs colorés dans les substrats. Un changement de couleur du milieu dans le tube, signifie généralement que le test est positif. Un tableau des caractères à vérifier pour chaque milieu est fourni par le fabriquant afin de permettre l’interprétation des résultats.

Interprétation des résultats :

Les tests sont regroupés par triplet de gauche à droite. Un test vaut :

Il faut ensuite additionner les trois valeurs obtenues pour obtenir le code du triplet (seules huit valeurs, de 0 à 7, sont possibles). Un code à sept chiffres est obtenu par lecture des codes des triplets de gauche à droite. Ce code, comparé à ceux référencés dans la base de données gérée par le fabricant, permet l’identification de la bactérie. 

Là où les techniques classiques nécessitaient une à trois semaines, les gammes miniaturisées permettent l’obtention des résultats sous 18 à 72 heures. Elles permettent, en outre, l’identification d’environ 800 bactéries et levures, ce qui couvre pratiquement l’ensemble des micro-organismes pathogènes de ce type.

Les informations présentées sont issues des fiches rédigées par des élèves ingénieurs de la spécialisation protection des cultures de l'ENSAIA dans le cadre des actions de l'axe 2 du RMT VEGDIAG.