Los conidióforos de Alternaria spp. suelen ser oscuros, simples o ramificados, más o menos retorcidos.
Los conidios se producen en el extremo de su cadena. Estos conidios multicelulares (= dictyospores) son inicialmente ovoides y luego terminan extendiéndose por un pico, luego tomando la forma de un club y gradualmente un tinte marrón (figura 1). Las particiones transversales y longitudinales de estos conidios constituyen una característica característica del género Alternaria . Ensambladas en cadenas de diferente longitud (figura 2), tienen forma irregular y dimensiones variables (20-80 x 9-18 µm). Su pico apical, bien diferenciado, no supera 1/3 de la longitud total del conidio.
Aspecto de las colonias en medio malta-agar : tienen un aspecto heterogéneo, áreas blancas estériles formadas por hifas aéreas que se alternan con áreas de pastoreo más oscuras en las que se producen conidios melanizados. Alternaria alternata crece rápidamente en este medio para dar inicialmente colonias en tonos grises, que se vuelven marrones con la edad.