Agrobacterium radiobacter

La radice del tappeto è una malattia relativamente antica da quando è stata descritta per la prima volta negli anni '70 nel Regno Unito e associata a un ceppo di Agrobacterium colture di cetriolo biovar 1 nel terreno sotto copertura. È stato osservato solo in questo paese sui pomodori dal 1997, principalmente nelle coltivazioni fuori suolo, dove il numero di piante colpite variava tra l'1 e il 50%. I ceppi di A. radiobacter portatori di un plasmide "Ri" ( che induce le radici ) erano responsabili. Infatti i sintomi alla radice sono indotti dal trasferimento e dall'espressione di questo plasmide nel genoma delle cellule di pomodoro. Lavori più recenti hanno mostrato che il plasmide “Ri” è presente anche in altre specie batteriche associate radicale all'apparato e appartenenti ad altri generi - Ochrobactum , Rhizobium , Sinorhizobium . Queste specie potrebbero svolgere un ruolo epidemiologico significativo nella malattia. Si noti che il root mat è ora riportato in diversi altri paesi europei come Paesi Bassi, Francia ...

 Le piante colpite mostrano una proliferazione radicale piuttosto lineare all'interno e sulla superficie di cubetti e panelli di lana di roccia (foto 514), che porta ad un aumento della crescita vegetativa dei pomodori a scapito della fruttificazione. Si noti che la dimensione dei frutti può essere ridotta. Inoltre, la densità delle radici le rende molto più suscettibili all'attacco dei funghi presenti nelle colture fuori suolo, in particolare dei cromisti ( Pythium spp., Phytophthora spp.).

Queste proliferazioni radicali sono dovute agli effetti di ceppi di A. radiobacter biovar 1 che ospitano un frammento di DNA circolare, un plasmide di cucumopina " Ri ", un induttore della radice. Infatti questo batterio, come nel caso di A. tumefaciens , funge da vettore e trasmette questo plasmide che verrà inserito nel genoma delle cellule vegetali. Successivamente, la produzione delle radici è totalmente interrotta, le piante producono in maniera anarchica. Il periodo di incubazione di questa malattia sembra essere piuttosto lungo, circa 4-8 settimane. L'isolamento e l'identificazione di questo batterio è piuttosto difficile e richiede l'intervento di un laboratorio specializzato (il plasmide può essere rilevato mediante PCR).

 È abbastanza difficile controllare questa malattia nelle colture di pomodoro fuori suolo. Non esiste, infatti, un prodotto che permetta di effettuare trattamenti efficaci e approvati durante la coltivazione. Solo alcune misure igieniche possono essere attuate in vivaio e durante la coltivazione per limitare la conservazione e la proliferazione di questo batterio:

• pulire e disinfettare accuratamente asili nido e rifugi con disinfettante. Tra due colture, il materiale utilizzato nelle serre non deve essere immagazzinato a terra o in un ambiente sporco perché potrebbe essere contaminato in questa occasione;
• la disinfezione del suolo sarà spesso illusoria perché questo batterio vi si conserva facilmente e lo ricolonizza rapidamente;
• i pani non devono essere a contatto con il suolo e i gocciolatori devono essere sospesi;
• quando si sostituisce la plastica che riveste il pavimento, bisognerà prestare particolare attenzione affinché la nuova non venga sporcata da polvere di terra sulla sua faccia superiore.

I tentativi di disinfettare il pane con il vapore si sono rivelati efficaci nell'uccidere i batteri, ma non il plasmide infettivo. Si noti che questa soluzione non è consigliata nei paesi interessati dal root mat .

 Va notato che una condizione abbastanza comparabile, chiamata " sindrome della radice spessa" e la cui origine è sconosciuta, è stata segnalata in particolare nei Paesi Bassi, principalmente nei vivai di cetrioli, peperoni e pomodori. Ne consegue una crescita eccessiva delle radici che tendono anche ad arricciarsi irregolarmente e ad assumere un aspetto vitreo. Il loro diametro è talvolta considerevole (almeno dieci volte più grande di quello di una radice normale) e alla fine si decompongono. Nota che sono molto più sensibili agli attacchi di Pythium spp.