La famille des Plasmodiophoraceae appartient aux Cercozoa parfois encore classés parmi les protistes. Dans cette famille on trouve des microorganisme pathogènes, endoparasites de plantes à plasmode, appartenant aux genres Plasmodiophora (figure 1), Polymyxa (figure 2), Spongospora et Woronina.

Plasmodiophora brassicae sur racines de chou hernie des crucifères	Polymyxa betae sur betterave transmet le virus BNYVV (Beet necrotic yellow vein virus)

Ces pathogènes sont des parasites obligatoires, mais ils peuvent survivre sous forme de spores de repos dans le sol, pendant plusieurs années. Ces parasites vivent au dépend des cellules qu'ils occupent mais ne les tuent pas. Ils peuvent dans certains cas stimuler la division des cellules qu'ils occupent ainsi que des cellules adjacentes pour détourner à leur profit l'afflux des nutriments.

Ces pathogènes se transmettent de plante à plante par l'intermédiaire de zoospores. Certains de ces microorganismes peuvent aussi transmettre des virus.